Чак Бартовски (Захари Леви) – главный герой сериала, милый, добрый, умный парень потерявшийся в жизни после исключения из Стэнфордского университета и предательства любимой девушки Джилл Робертс (Джордана Брюстер). Чак работает в Бёрнбанковском отделении сети магазинов «Купи больше» и живет со старшей сестрой Элли (Сара Ланкастер) и её парнем Девоном (Райан МакПартлин). Среди его коллег верный друг детства Морган Граймс (Джошуа Гомез), его сексапильная подружка Анна Ву (Джулия Линг), парочка авантюристов и по совместительству музыкантов Джефф (Скотт Крински) и Лестер (Вик Сахай), а также менеджер магазина Большой Майк (Марк Кристофер Лоуренс). В ночь своего дня рождения Чак получает электронное письмо от своего бывшего лучшего друга из Стэнфорда Брайса Ларкина (Мэттью Бомер). Когда Чак открывает это письмо, в его мозг посредством серии закодированных изображений загружается правительственный супер-компьютер под названием Интерсект. После этого жизнь Чака кардинально меняется. Он, как носитель Интерсекта, должен работать на правительство, появляются агент ЦРУ Сара Уолкер (Ивонн Страховски) и майор АНБ Джон Кейси (Адам Болдуин), приставленные к нему, чтобы защищать.
Первый сезон
Несмотря на всю свою уникальность, Чак считает себя круглым неудачником и мечтает извлечь из головы Интерсект. Начинается его оперативная деятельность на миссиях. Чаку очень нравится Сара, его куратор из ЦРУ, и очень не нравится Кейси – из АНБ. ЦРУ и АНБ враждуют, но по инициативе Чака начинают работать вместе под предводительством генерала Дайан Бекман, отдающей приказы команде в основном по видеосвязи в секретной подземной базе, расположенной прямо под двумя магазинами: "Купи Больше" и лавкой Сары, где она торгует "под прикрытием". Они борятся против преступного подразделения «Фалкрум», которое, как и все злодеи, мечтает захватить мировое господство. А для этого им нужно найти Интерсект.
Второй сезон
Чак все еще хочет извлечь из головы Интерсект и разыскивает человека под псевдонимом Орион, изобретателя интерсекта, но находит отца. Сара уходит от искушения сбежать с агентом британской разведки Коулом Баркером, направленного им на помощь в борьбе с Фалкрумом, который питает к ней тёплые чувства. Также он узнает подлинные мотивы Джил, своей бывшей сокурсницы: причины их ссоры и её истинное лицо: она является агентом Фалкрума, но даже несмотря на неоднократное предательство с её стороны, Чак помогает ей бежать и даёт ей возможность начать новую жизнь. К концу сезона Чак и Сара сближаются. На фоне бурной шпионской деятельности не даёт о себе забыть и родной магазин Чака - Большой Майк влюбляется в мать Моргана, по его (Моргана) вине Большого Майка понижают в должности, а скользкий тип Эммет захватывает кресло управляющего. Морган не может больше выносить обстановку торгового центра и, уволившись, осуществляет свою давнюю мечту. После всех событий Чак решает последовать его примеру. Сестра Чака, Элли, выходит замуж, её мечта также исполняется - отец ведёт её к алтарю. Сезон кончается открытием, что Орион и отец - одно лицо, а также обнаружением проекта Интерсект 2.0, который был разработан Брайсом Ларкиным. Чак уничтожает его, в последний момент сохраняя копию в очень надежном месте...
Третий сезон
Интерсект 2.0 оказался не просто Интерсектом, а обучающей программой для нового поколения шпионов. Теперь Чак стал шпионом мирового масштаба с уникальными способностями. В связи с его внезапно открывшимися талантами, Кейси взялся за обучение Чака и превращением его в настоящего профессионала. После череды неудач на любовном фронте Чак и Сара наконец-то вместе, но новый злодей не дремлет. Преступная организация «Кольцо», частью которого был Фалкрум, хочет править миром, и Чак со своей командой должны помешать им. По стечению обстоятельств, в поисках Чака агент "Кольца" убивает надоедливого нового директора "Купи Больше" Эммета. Зять Чака "Капитан Великолепный", он же Девон Вудкомб, который узнал тайну Чака в конце второго сезона, ввязавшись в несколько шпионских переделок, «умывает руки».
О секрете Чака узнает и его лучший друг Морган, который тоже становится частью шпионской команды. Кроме того, с мозгом Чака происходит что-то неладное и он на несколько дней попадает в психбольницу. Вновь появляется его отец и делает для Чака «Правитель» - устройство, способное контролировать Интерсект. Вскоре, «Правитель» похищают, а отца Чака убивают. Элли узнает всю правду и становится свидетельницей этого убийства. Она вместе с Дэвоном и Морганом спешит на помощь команде Бартовски. Чак борется с новым носителем Интерсекта - Дэниэлом Шоу, являющимся двойным агентом - ЦРУ и «Кольца» - и начинает проигрывать. Всё осложняется тем, что теперь он - в команде Чака, к тому же у них взаимная симпатия с Сарой - ответ взаимной симпатии Чака и его новой знакомой Ханны. Но, благодаря своим уникальным способностям и смекалке, Чак открывает его истинное лицо и предотвращает переворот в штаб-квартире ЦРУ, в ходе которого коррумпированные чиновники - члены "Кольца" - уже успели нейтрализовать генерала Бекман, ответственную за проект Интерсекта. Элли взяла с него обещание покончить с жизнью шпиона. Но Чак пообещал отцу, что найдет свою мать, поискам которой его отец посвятил всю жизнь. У Кейси, как оказалось, есть дочь. А ещё Чак, Морган, Кейси и все остальные работники «Купи больше» остались без работы – магазин взорван.
Четвертый сезон
«Купи больше» отстроили и теперь это новейшая технологизировання база ЦРУ и АНБ. Морган становится менеджером магазина и возвращает весь предыдущий персонал во главе с Джеффом и Лестером. Кроме того, после разрыва с Анной новоявленный менеджер начинает встречаться с дочерью Кейси. Чак и Морган отправляются на поиски мамы Чака. Позже им в этом помогают Кейси и Сара. Оказалось, что мать Чака – бывший агент ЦРУ, которая почти 20 лет работает в преступной организации, занимающейся производством и сбытом оружия «Волков Индастрис». К тому же выясняется, что, скрываясь от своих родных, Мэри в прямом смысле спасала их от постоянной угрозы со стороны Волкова. Она пожертвовала семейной жизнью, покинув детей много лет назад, в обмен на их безопасность. Также Чак скоро станет дядей, поэтому он с ещё большим рвением хочет найти маму. Сара становится двойным агентом у "Волков Индастрис" и они вместе с Чаком, матерью и его командой сажают Волкова в тюрьму и разрушают компанию. У Эли рождается дочь Клара. Чак делает предложение Саре и они готовятся к свадьбе.
Компьютер, который был завещан Элли её отцом, содержит важную, но недоработанную информацию об исследованиях, связанных с Интерсектом. Элли продолжает работу. Появляется дочь Волкова, Вивиан, и получает наследство своего отца. В старом ноутбуке Ориона Элли находит файлы о таинственном агенте Х, которым оказывается старый друг Ориона, которого превратили в Алексея Волкова. При попытке захватить разработанное «Волков Индастрис» супероружие "Викинг", которое может избирательно убить любого человека по его ДНК, Сара убивает наставника Вивиан в "преступном мире", который завлёк её в мир преступности, в ответ Вивиан использует "Викинга" на Саре прямо в день их свадебной вечеринки. Чак, естественно, не мог позволить ей умереть, поэтому подключил к её спасению всех, кого мог - в первую очередь сестру с мужем, которые, будучи врачами, дали Саре необходимое время, после чего отправился за Алексеем Волковым прямо в тюрьму. Волкова он освободил, но, оказалось, что из него удалили программу, которая делала его безжалостным психопатом-олигархом, и теперь он оказался тем самым учёным, который постарел на 30 лет, обзавёлся дочерью-гангстером и не имеет никакого понятия о происходящем.
Тем не менее, он-таки смог найти антидот, оказавшийся не совсем подходящим, после чего отправился вместе с Чаком к своей дочери Вивиан за настоящим антидотом. Они умоляют её отдать антидот, а Волков пытается убедить дочь отречься от мафии. Тем временем, лицо, стёршее криминальное прошлое Алексея, пытается помешать команде Бартовски спасти Сару, но Чак прибегает к помощи "кошек", давних боевых подруг Сары, и вместе с ними и русским спецназом проходит к больнице и спасает Сару. Они женятся, получают в подарок все активы "Волкофф Индастриз" и покупают "Купи Больше". Интерсект из Чака удалён, а взамен Бекмен присылает новый под видом солнечных очков с суперкомпьютером, которые по ошибке надевает Морган.
Пятый сезон